1. Аппарат управления.

2. Отдел бухгалтерского учета и заработной платы.

3. Отдел мониторинга почв и применения средств химизации:

    -  лаборатория полевых изысканий;

    -  лаборатория применения средств химизации и изготовления проектно-сметной документации;

    -  лаборатория землеустроительных работ;

4. Испытательная лаборатория.

4.1. Отдел технического анализа.

4.2. Отдел анализа безопасности продукции.

    -  лаборатория токсикологии;

    -  лаборатория радиологии;

    -  лаборатория охраны окружающей среды;

    -  лаборатория микробиологии и паразитологии;

 4.3. Отдел химико-аналитических исследований продукции. 

    - лаборатория анализа почв и агрохимикатов;

     - лаборатория анализа растениеводческой, пищевой продукции и кормов;

Штат агрохимцентра - 82 сотрудника, 59 - с высшим образованием, 3 - со специальным  техническим образованием.

Для выполнения поставленных перед учреждением задач имеется хорошая материально-техническая база: современные лабораторные приборы и оборудование, компьютерная,  множительная техника, достаточное количество транспортных средств.